MENU

上田 宏生 特任准教授

上田 宏生

上田 宏生 特任准教授

/ Hiroki UEDA

Researchmap
  • 所属

    千葉大学 国際高等研究基幹 / 健康疾患オミクスセンター

  • 研究キーワード

    RNA修飾、がんゲノミクス、ナノポアシーケンサ、深層学習、エピトランスクリプトミクス、シングルセル解析、空間オミクス

  • 所属学会情報

    日本癌学会、日本RNA学会、日本分子生物学会

研究テーマ

RNA修飾によるがん進展メカニズムの解明および解析手法の開発

研究概要

RNA修飾は生命進化において極めて保存された機構であり、多様な生命現象を制御している。近年の研究から、その制御異常はRNAスプライシング、分解、翻訳効率の変化を誘発し、がんの進展や悪性化に深く関与することが明らかとなってきた。
しかし、多様なRNA修飾を網羅的かつ高精度に検出する手法は未だ発展途上にある。
そこで、ナノポアシーケンサから得られる生信号データを深層学習によって解析し、未知のRNA修飾を1分子レベルで同定する新規アルゴリズムの開発を行っている。さらに、シングルセル解析や空間オミクス解析への応用を見据えた次世代解析プラットフォームの構築を進め、トランスクリプトームワイドなRNA修飾解析技術を確立することで、がんの病態解明を加速し、より効果的な治療法の創出や、エピトランスクリプトミクスに基づく個別化医療(パーソナライズド・メディシン)の実現を目指す。